不出意外，以封建日本為背景的《刺客教條：暗影者》在日本當地的評價很差，在零售網站亞馬遜日本上，PS5版用戶評分2.2分，共有23條評價，反映出日本玩家幾乎沒有人買這款遊戲。
用戶按讚最多的評論指責《刺客教條：暗影者》是一款以「偽造日本歷史為目的製作的遊戲」，以「黑命貴（BLM）」意識形態給玩家洗腦，不尊重皇室。
「《刺客教條：暗影者》主要根據歷史準確性值得懷疑的耶穌會傳教士的記錄改編，將織田信長的僕人彌助描繪成一位傳奇武士。彌助的形象被嚴重扭曲，故事中他到達日本後立刻就能夠說一口極其流利的日語，而到達日本六個月後便指揮織田軍，燒毀了伊賀，並被阿市引誘而發生了性關係。」
《刺客教條：暗影者》Steam在線峰值僅6萬人左右，不及《闇龍紀元：紗障守護者》，後者Steam同時在線峰值接近9萬人，但EA仍將《闇龍紀元：紗障守護者》視為重大失敗。
