超夢的另一個個體登場於BW特別篇超夢通往覺醒的序章和劇場版神速的蓋諾賽克特超夢覺醒，這個個體同樣是被人類製造出來的，但劇中沒有說製造者的身份，它和另一個個體一樣摧毀了研究所，可它並沒有另一個個體那樣的實力，光是逃跑就消耗了它全部的體力，傷痕累累的它暈倒在了一處山洞中，它本不想和野生寶可夢接觸，但寶可夢們不僅不害怕它而且還給它療傷，這個與一代截然不同的遭遇也讓這個超夢及時意識到了生命的意義，從一開始它就把寶可夢們當做自己的朋友，也並沒有產生過毀滅和復仇這樣的極端念頭。
不過它和一代個體一樣也遭到過人類的追捕，只不過不是坂木老大，而是一個叫做丹克的寶可夢獵人，他使用的騎士蝸牛和班吉拉實力很強，輕鬆將超夢打成重傷，不過由於招式威力太強造成山體滑坡，這才放跑了超夢，身負重傷的超夢躲在山洞裡的泉水裡療傷，期間被巴吉爾等人的寶可夢發現，它們想要幫助超夢，但被超夢拒絕，沒過多久丹克捲土重來，通過破壞逼著超夢現身，受傷的超夢不敵班吉拉和騎士蝸牛，但它自己進行了mega進化變成了mega超夢Y扭轉了局勢，期間它用超能力引來湖水撲滅了爆炸引起的森林大火，此外它十分有戰術頭腦，直接毀壞了丹克的精靈球，從而讓班吉拉和騎士蝸牛變成了野生寶可夢，瞬間瓦解了丹克的戰力，這一次的經歷讓它同時見識了好人和壞人，因此並沒有改變它那一顆熱忱之心。
一段時間後超夢在野外聽到「想要回家」的聲音，循著聲源找到了蓋諾賽克特軍團，它們記憶中的家園已經面目全非，看到有著類似遭遇的寶可夢超夢毫不猶豫的施以援手，但是蓋諾賽克特並不領情反而攻擊了超夢，超夢無意與其交戰只得退走，接著一直觀察著它們的行動。
後來蓋諾賽克特前往了紐特市，在這裡超夢與同樣想要幫助蓋諾賽克特回家的小智相遇，小智的話同樣不被蓋諾賽克特理解，超夢驚訝於小智的勇氣，也出手保護了小智。
蓋諾賽克特在晚上進攻了寶可夢山莊，它們破壞了當地的環境，趕跑了居住的寶可夢，打算在這裡構築自己的巢穴，超夢通過讀取能力發現蓋諾賽克特有著和自己一樣的被改造經歷，它更加堅定了幫助蓋諾賽克特軍團的想法。
超夢發覺紅色蓋諾賽克特是首領，它想要和對方單獨談談，可對方蠻不講理的在城市中與mega超夢Y展開激烈交戰，留在寶可夢山莊的蓋諾賽克特卻被原住民和小智等人攻擊，陷入狂暴狀態的紅色蓋諾賽克特返回後連帶自己同伴一起攻擊。
為了防止無辜的寶可夢和設施遭到破壞，超夢最後一次警告了紅色蓋諾賽克特，可對方仍舊不聽勸，超夢只得動用武力，它進行了mega進化擊潰了其他蓋諾賽克特，並將紅色蓋諾賽克特帶到了宇宙中並和它說「我們都是在這個星球上出生的寶可夢」，在浩瀚的宇宙中紅色蓋諾賽克特終於理解了言外之意，既然都是同胞那麼沒必要爭鬥也能和諧共存。
於是它和超夢握手言和，但超夢之前戰鬥消耗了太多的體力，現在精疲力盡的它暈了過去，好在有蓋諾賽克特，寶可夢山莊和小智一行人的幫助，這才讓它平穩落地。
最後蓋諾賽克特選擇居住在寶可夢山莊，超夢看見它們真心悔改，並且和之前寶可夢山莊的寶可夢相處融洽，於是和眾人告別，之後不知所蹤。
這個個體的超夢性格比較溫柔，它沒有一代那麼極端，會主動對陷入困境的人類和寶可夢伸出援手，也很容易和善良的人和寶可夢成為朋友，但即便它能夠mega進化變成mega超夢Y，就戰鬥力而言它還是不如一代的。
